La ville de Yaoundé est située au sud de la région du Centre et est éloignée de 250 km à l’est des côtes du Golfe du Biafra. Ce site de montagnes se décompose en trois unités topographiques inscrites dans un socle rocheux de gneiss précambrien : la barrière d’inselbergs au Nord-Ouest dominée par les monts Mbam Minkom (1 295 m) et le mont Nkolodom (1 221 m) et au sud-ouest avec le mont Eloundem (1 159 m) ; un ensemble de collines de 600 à 700 m d’altitude et de plateaux ; les vallées appelées également « élobis ». Les différents quartiers s’ordonnent en fonction du relief accidenté du site de la ville. Les routes et les bâtiments se développent principalement sur les hauteurs des différentes collines, tandis que les bas-fonds marécageux laissent souvent place à de l’agriculture vivrière, à la végétation et à de nombreux petits cours d’eau. Quelques-uns parmi eux sont les rivières Mfoundi, Ékozoa, Biyeme et Mefou. Près du centre administratif de Yaoundé se trouve un lac appelé « Lac municipal de Yaoundé », crée en 1951-1952. Les bas-fonds marécageux sont également une réserve foncière pour le développement de l’habitat précaire : le géographe Martin Luther Djatcheu a montré comment ce type d’habitat autoconstruit s’est développé dans les parties inondables de la ville, à la suite de la forte croissance démographique. La ville de Yaounde se situe sous un climat tropical de savane caractérisé par de nombreux mois de fortes pluies. La saison sèche s’étend de fin novembre à février. La saison des pluies connait un affaiblissement des précipitations en juillet et août. Le climat de Yaoundé est tropical, bien que tempéré par l’altitude, avec une saison sèche de décembre à février et une saison des pluies de mars à novembre. Les pluies diminuent un peu en juillet et août, bien que le ciel soit souvent nuageux. la température moyenne du mois le plus froid (août) est de 23,2 °C, celle du mois le plus chaud (février) est de 25,8 °C. Les précipitations totalisent 1540 millimètres par an : elles sont donc abondantes. Dans les mois les moins pluvieux (janvier, décembre) elles s’élèvent à 20 mm, dans le mois le plus pluvieux (octobre) elles s’élèvent à 295 mm. Voici la moyenne des précipitations.